La Institución Educativa Liceo Moderno del Sur, ubicada en el barrio San Juan de Ciénaga, Magdalena, fue fundada el 30 de julio de 1996 durante la administración del alcalde Luis Gastelbondo García, con Hermes Enrique Algarín como secretario de educación municipal. Su creación fue oficializada mediante el Acuerdo No. 033 del 9 de diciembre de 1996 .

El plantel principal se construyó en el terreno donde anteriormente funcionaba la curtiembre “Escopiel”, adquirido por el municipio y financiado con recursos del Fondo de Inversión Social (FIS) . En septiembre de 2000, la institución obtuvo la aprobación oficial para ofrecer educación básica, y en marzo de 2001, para educación media. En 2003, mediante el Decreto No. 001 del 14 de marzo, se consolidó como Institución Educativa al integrar varias escuelas primarias del área, convirtiéndose en un eje de integración educativa .